国内刊号:42-1678/R
国际刊号:1672-0741
发布日期:
作者:刘婧婷,隆建萍,金凤玲,林碧玉,王文第,裴建赢,王晶晶
单位:兰州大学1第一临床学院 3第一医院感染管理科,兰州 730000甘肃省妇幼保健院2乳腺一科 4妇幼保健科研中心,兰州 730050
关键词:乳腺癌, 细胞分裂周期相关蛋白, 生物信息学,
基金:甘肃省自然科学基金资助项目(No.17JR5RA030)
目的 利用生物信息学方法研究细胞分裂周期相关蛋白(CDCAs)介导乳腺癌的潜在靶向基因、信号传导通路及分子机制。方法 从 GEO 和 TCGA 数据库下载正常乳腺组织和乳腺癌样本的基因芯片;使用 R 软件limma包分析正常乳腺组织和乳腺癌样本之间的差异表达基因;使用 Kaplan-MeierPlotter评估乳腺癌患者的整体生存率、无复发生存率和无远处转移生存率;对筛选出的差异表达基因进行 GO 和 KEGG信号通路富集分析。结果 通过对差异表达基因的趋势分析,筛选出2015个显著上调的基因以及864个显著下调的基因,其中 CDCA1/2/3/5/7/8可能为介导乳腺癌浸润性进展的相关基因。生存分析表明,乳腺癌 CDCA1/2/3/5/7/8高表达与不良预后相关(均 P<0.05)。GO 分析结果主要富集于细胞有丝分裂周期、染色姐妹单体分离、染色体、着丝粒、纺锤体等;KEGG 信号通路富集分析则在卵母细胞减数分裂、p53信号通路、DNA 复制显著富集。结论 整合生物信息学分析结果,表明 CDCAs在乳腺癌组织中表达升高,并且 CDCAs表达水平显著影响乳腺癌患者预后,与其他 CDCAs相比,CDCA2/3/5/8可能是乳腺癌患者靶向治疗的合适靶点。
来源:2022年第2期
《华中科技大学学报(医学版)》期刊编辑部