华中科技大学学报(医学版)

作者：宋乃成,王磊,张彬,李寿康,郑志坤,李劲松

单位：华中科技大学同济医学院附属协和医院 1胸外科 2肿瘤科,武汉 430022

关键词：食管鳞状细胞癌, ZNF185, 转录组测序, 信号通路,

基金：湖北陈孝平科技发展基金会青年科学专项基金资助项目(No.CXPJJH11900018-05)

摘要:目的 通过转录组测序及生物信息学技术分析 ZNF185在食管鳞状细胞癌(食管鳞癌)中的作用机制及其下游信号通路。方法 利用shRNA 转染食管鳞癌细胞系 Eca-109敲低ZNF185的表达,采用转录组测序技术检测 mRNA的表达变化。根据测序数据筛选差异基因,通过 GO 功能分析和 KEGG富集分析对差异基因相关的功能及信号通路进行分析。通过STRING工具 分 析 差 异 蛋 白 的 相 互 作 用,构 建 出 相 关 的 蛋 白 互 作 网 络,分 析 关 键 节 点 蛋 白。结 果ZNF185干扰组与干扰对照组 Eca-109细胞的差异基因共有3859个,其中表达升高的基因有2112个,表达下降的基因有1747个。显著富集的 GO 项目包括 RNA 剪接、细胞-基质连接、局部粘附等。KEGG 富集分析表明 ZNF185可能与HIF-1信号通路、p53信号通路有关,蛋白互作网络分析发现了 BMP2、OAS2等关键蛋白。结论 通过转录组测序和生物信息分析筛选出ZNF185参与调控食管鳞癌可能的信号通路,为阐明食管鳞癌的发病机制提供了新的思路。

来源：2022年第3期

《华中科技大学学报(医学版)》期刊编辑部

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